SAVALnet — nauka i medycyna

Martwe komórki ze wszystkich tkanek uwalniają swoje DNA do krwioobiegu w postaci wolnego od komórek DNA (cfDNA). Rozwój i leczenie wielu chorób, takich jak rak, choroby autoimmunologiczne i posocznica, może wpływać na śmiertelność komórek, wpływając na fragmenty cfDNA w odpowiednich tkankach we krwi. Dlatego może ujawnić zmienioną homeostazę tkanek z powodu chorób i uszkodzeń tkanek obocznych w wyniku leczenia. W efekcie daje nieinwazyjny i kompleksowy obraz samopoczucia we wszystkich tkankach organizmu.

Odszyfrowanie pochodzenia tkanki cfDNA, tj. dekonwolucja, ma ogromny potencjał kliniczny, aby pomóc w diagnozowaniu, prognozowaniu i dalszym leczeniu chorób.

Zespół badawczy kierowany przez dr. Xianghong Jaśmin ChuProfesor Patologii i Medycyny Laboratoryjnej przy ul Szkoła Medyczna UCLA Davida Geffena (USA)dokonała wielkiego przełomu w rozwiązywaniu jednego z głównych wyzwań testów bezkomórkowego DNA (cfDNA), znanych również jako płynne biopsje. Zidentyfikowali specyficzne tkankowo specyficzne wzorce metylacji, które mogą pomóc zidentyfikować powiązane zmiany, stanowiące zasadnicze wyzwanie dla dokładnej diagnozy i monitorowania choroby.

Zespół opracował kompleksowy atlas metylacji o wysokiej rozdzielczości w oparciu o obszerny zestaw danych 521 próbek tkanek nienowotworowych reprezentujących 29 głównych typów.

Nazwali to w ten sposób cfSortuji wykazał sukces w identyfikacji tkankowo specyficznych i unikalnych wzorców metylacji na poziomie fragmentów i potwierdził te odkrycia za pomocą dodatkowych zestawów danych.

Idąc dalej, kliniczne zastosowania cfSort są demonstrowane przez dwa możliwe zastosowania: pomoc w diagnozowaniu chorób i kontrolowanie skutków ubocznych leczenia. Szacując fragment cfDNA, byli w stanie ocenić i przewidzieć wyniki kliniczne u pacjentów.